cBioPortal では、データをダウンロードすることもできます。操作は、閲覧するときと同様ですが、最初に “Query” ではなく、 “Download Data” タブを選択してから行います。
(1) Download Data タブをクリックします。
(2) データセット（がんの種類、 CancerStudy）を選択します。
(3) データの種類を選択します。RNASeq、microRNA、通常のマイクロアレイなどから選択します。 mRNA expression の Z-scores は、 Z-score 化されたシグナル値です。（ratio とは異なります。） コントロールまたは全サンプルの平均値から、標準偏差 (=SD) の何個ぶん離れているかを表したものです。Z-score > 2 （増加）もしくは、 Z-score < -2 （減少）で有意となります。
上図の例では、Z-score ではなく、シグナル値の形式を選択しています。
(4) 取得したい遺伝子名を Official Symbol で入力します。リストから決まった遺伝子群を選択することも可能です。
(5) Submit をクリックすると、タブ区切りのテキスト形式のデータを取得できます。
